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目录

第1章 组蛋白、核小体和染色质结构 1

1.1 染色质结构简介 1

1.2 染色质结构研究历史 3

1.3 核小体核心颗粒结构 4

1.4 连接组蛋白和染色质小体 16

1.5 染色质的结构 16

1.6 展望 19

致谢 19

参考文献 19

第2章 在染色质组装和解聚中的组蛋白分子伴侣 25

2.1 简介 25

2.2 组蛋白从细胞质到细胞核的转运 29

2.3 依赖染色质组装 31

2.4 着丝粒染色质的重新组装 36

2.5 组蛋白分子伴侣与非依赖染色质解聚和组装 39

2.6 DNA修复过程中染色质组装和解聚中的组蛋白分子伴侣 44

2.7 结束语 46

参考文献 46

第3章 染色质重塑复合物 57

3.1 简介 57

3.2 重塑因子分类 60

3.3 重塑机制和调控 73

3.4 重塑因子在体加工能 82

3.5 参与细胞多能、发育和分化调节的重塑因子 93

3.6 重塑因子与 99

3.7 染色质重塑因子和疾病综合征 102

参考文献 104

第4章 组蛋白乙酰化对染色质的调节 124

4.1 简介 125

4.2 组蛋白乙酰转移酶及其复合物 127

4.3 组蛋白去乙酰化 133

iv 染色质基础与表观遗传学调控

4.4 乙酰化模块阅读器 137

4.5 组蛋白乙酰化对染色质/核小体结构的影响 138

4.6 组蛋白乙酰化在组蛋白沉积和染色质组装中的作用 139

4.7 组蛋白乙酰化在基因表达调控能 142

4.8 DNA 修复中组蛋白乙酰化的作用 146

4.9 酶相互作用调节组蛋白乙酰化及与其他修饰的串扰 149

4.10 组蛋白乙酰化与人类疾病和靶标的出现 151

4.11 展望：组蛋白乙酰化与细胞代谢之间的联系 154

致谢 155

参考文献 155

第5章 染色质信号转导中的组蛋白甲基化 182

5.1 简介 182

5.2 组蛋白甲基化：历史的视角 185

5.3 组蛋白赖氨酸甲基化信号传递 186

5.4 组蛋白甲基化和DNA甲基化 3

5.5 组蛋白甲基化和 5

5.6 组蛋白精氨酸甲基化 7

致谢 8

参考文献 9

第6章 组蛋白泛素化调控基因表达 2

6.1 泛素化是一种可逆的翻译后修饰 221

6.2 组蛋白的泛素化修饰 222

6.3 特异E2/E3酶催化组蛋白单泛素化 224

6.4 组蛋白的单泛素化可以被去泛素化酶逆转 231

6.5 组蛋白单泛素化调控基因转录 233

6.6 组蛋白泛素化和DNA修复 248

6.7 组蛋白单泛素化调控细胞周期 253

6.8 结论 253

参考文献 254

第7章 PARP-1和ADP-核糖基化对染色质结构能的调控 262

7.1 简介 262

7.2 PARP-1、聚ADP-核糖基化和PARP家族 262

7.3 PARP-1对染色质结构和基因表达的调控 266

7.4 PARP-1在异染色质能 274

7.5 PARP-1定位和染色质活的调节 276

7.6结和结论 281

参考文献 281

第8章 组蛋白磷酸化和染色质动力学 287

8.1 简介 287

8.2 组蛋白H1磷酸化 288

8.3 组蛋白H3磷酸化 290

8.4 组蛋白H2A磷酸化 291

8.5 阅读器蛋白翻译组蛋白修饰 294

8.6 结论和展望 294

参考文献 295

第9章 组蛋白修饰的读取 299

9.1 简介 299

9.2 组蛋白修饰模块的读取 302

9.3 读取方法 303

9.4 读取的特异 306

9.5 读取组蛋白修饰能效果 307

9.6 展望 310

致谢 311

参考文献 311

第10章 组蛋白变体的质能 316

10.1 简介 316

10.2 组蛋白变体的特征 321

10.3 组蛋白变体在DNA上的沉积 324

10.4 组蛋白变体的重要 331

参考文献 344

第11章 染色质的转录 361

11.1 简介 361

11.2 转录周期 362

11.3 基因上的染色质结构 370

11.4 转录相关的转录后修饰 371

11.5 转录中的染色质重塑 380

11.6 延伸过程的组蛋白动力学 384

11.7 调控延伸过程的组蛋白动力学 385

11.8 非编码转录：调节和结果 389

11.9 结论 391

参考文献 392

第12章 DNA修过程中的染色质重塑 416

12.1 简介 416

12.2 DNA 双链损伤修复中的染色质重塑 416

12.3 DNA过程中的染色质重塑 434

12.4 结束语 438

参考文献 438

第13章 异染色质：基因组的重要成分 447

13.1 为什么研究异染色质? 448

13.2 异染色质的构成 449

13.3 异染色质组装 453

13.4 异染色质的遗传剖析 454

13.5 异染色质形成：RNAi的作用 456

13.6 核组织动力学 458

13.7 异染色质与疾病 460

13.8 异染色质的未解之谜 461

参考文献 461

第14章 染色质研究新兴领域 468

14.1 细胞信号的重要 468

14.2 染色质接受应激活化蛋白激酶的信号 468

14.3 应激信号、S展和转录相关重组 470

14.4 非编码RNA参与表观遗传调控 470

14.5 细胞代谢对组蛋白修饰的影响 473

14.6 生物钟中组蛋白修饰的波动 476

14.7 DNA甲基化决定细胞类型的特异 477

14.8 表观遗传学和衰老 478

14.9 结论和展望 479

致谢 479

参考文献 479

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